| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D3126 | 深圳北 | 06:59 | 厦门北 | 10:28 | 南通西 | 20:03 | 扬州 | 21:40 |
| D2284 | 东莞南 | 07:40 | 厦门北 | 11:39 | 南通 | 20:38 | 南通 | 20:38 |
| D2285 | 东莞南 | 07:40 | 厦门北 | 11:39 | 南通 | 20:38 | 南通 | 20:38 |
| D2290 | 深圳北 | 08:55 | 厦门北 | 12:36 | 南通 | 22:13 | 南通 | 22:13 |
| D3206 | 厦门北 | 12:52 | 厦门北 | 12:52 | 南通 | 21:54 | 南通 | 21:54 |
| D3202 | 厦门北 | 13:29 | 厦门北 | 13:29 | 南通 | 22:43 | 南通 | 22:43 |