| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 查询站 | 到站时间 | 离站时间 | 终点站 | 终到时间 |
| C3801 | 南通 | 05:55 | 南通 | - | 05:55 | 上海 | 07:31 |
| C3804 | 南通 | 05:55 | 南通 | - | 05:55 | 上海 | 07:31 |
| C3709 | 南通 | 06:02 | 南通 | - | 06:02 | 上海虹桥 | 07:31 |
| C3712 | 南通 | 06:02 | 南通 | - | 06:02 | 上海虹桥 | 07:31 |
| C3782 | 南通 | 06:07 | 南通 | - | 06:07 | 南京 | 08:42 |
| G2655 | 南通 | 06:12 | 南通 | - | 06:12 | 哈尔滨西 | 19:57 |
| G2658 | 南通 | 06:12 | 南通 | - | 06:12 | 哈尔滨西 | 19:57 |
| G2629 | 南通 | 06:20 | 南通 | - | 06:20 | 沈阳 | 19:21 |
| G2632 | 南通 | 06:20 | 南通 | - | 06:20 | 沈阳 | 19:21 |
| C3762 | 南通 | 06:30 | 南通 | - | 06:30 | 南京 | 09:09 |
| D3201 | 南通 | 06:35 | 南通 | - | 06:35 | 厦门北 | 16:27 |
| C3805 | 南通 | 06:52 | 南通 | - | 06:52 | 上海 | 08:30 |
| C3808 | 南通 | 06:52 | 南通 | - | 06:52 | 上海 | 08:30 |
| C3701 | 南通 | 06:57 | 南通 | - | 06:57 | 湖州南浔 | 09:35 |
| C3704 | 南通 | 06:57 | 南通 | - | 06:57 | 湖州南浔 | 09:35 |
| D5441 | 南通 | 07:08 | 南通 | - | 07:08 | 南京 | 10:48 |
| D5444 | 南通 | 07:08 | 南通 | - | 07:08 | 南京 | 10:48 |
| D1664 | 南通 | 07:25 | 南通 | - | 07:25 | 太原南 | 17:51 |
| D1665 | 南通 | 07:25 | 南通 | - | 07:25 | 太原南 | 17:51 |
| D2292 | 南通 | 07:30 | 南通 | - | 07:30 | 深圳北 | 20:22 |
| D2289 | 南通 | 07:30 | 南通 | - | 07:30 | 深圳北 | 20:22 |
| C422 | 启东 | 06:50 | 南通 | 07:36 | 07:42 | 南京 | 10:17 |
| Z51 | 北京 | 18:54 | 南通 | 08:20 | 08:30 | 启东 | 09:25 |
| D3205 | 南通 | 08:21 | 南通 | - | 08:21 | 厦门北 | 17:17 |
| G2586 | 南通 | 08:29 | 南通 | - | 08:29 | 北京南 | 14:31 |
| G1301 | 南通 | 08:41 | 南通 | - | 08:41 | 珠海 | 20:04 |
| G1304 | 南通 | 08:41 | 南通 | - | 08:41 | 珠海 | 20:04 |
| K1984 | 启东 | 08:30 | 南通 | 09:32 | 09:50 | 吉林 | 17:53 |
| K1985 | 启东 | 08:30 | 南通 | 09:32 | 09:50 | 吉林 | 17:53 |
| D2283 | 南通 | 09:40 | 南通 | - | 09:40 | 深圳北 | 22:26 |
| D2286 | 南通 | 09:40 | 南通 | - | 09:40 | 深圳北 | 22:26 |
| K563 | 太原 | 15:55 | 南通 | 09:47 | 10:17 | 海门 | 10:44 |
| K566 | 太原 | 15:55 | 南通 | 09:47 | 10:17 | 海门 | 10:44 |
| Z29 | 北京 | 21:27 | 南通 | 09:55 | 10:01 | 启东 | 10:43 |
| G2679 | 南通 | 10:06 | 南通 | - | 10:06 | 贵阳北 | 23:13 |
| G2682 | 南通 | 10:06 | 南通 | - | 10:06 | 贵阳北 | 23:13 |
| C433 | 南京 | 07:57 | 南通 | 10:38 | 10:40 | 启东 | 11:25 |
| C436 | 南京 | 07:57 | 南通 | 10:38 | 10:40 | 启东 | 11:25 |
| C421 | 南京 | 08:50 | 南通 | 11:26 | 11:33 | 启东 | 12:33 |
| C424 | 南京 | 08:50 | 南通 | 11:26 | 11:33 | 启东 | 12:33 |
| K91 | 启东 | 10:10 | 南通 | 11:30 | 11:56 | 深圳东 | 13:56 |
| K94 | 启东 | 10:10 | 南通 | 11:30 | 11:56 | 深圳东 | 13:56 |
| K564 | 海门 | 11:58 | 南通 | 12:25 | 12:36 | 太原 | 07:58 |
| K565 | 海门 | 11:58 | 南通 | 12:25 | 12:36 | 太原 | 07:58 |
| C3765 | 南京 | 10:00 | 南通 | 12:38 | - | 南通 | 12:38 |
| C3768 | 南京 | 10:00 | 南通 | 12:38 | - | 南通 | 12:38 |
| C434 | 启东 | 11:47 | 南通 | 12:39 | 12:42 | 南京 | 15:22 |
| C3706 | 上海虹桥 | 11:19 | 南通 | 12:53 | - | 南通 | 12:53 |
| C3707 | 上海虹桥 | 11:19 | 南通 | 12:53 | - | 南通 | 12:53 |
| T141 | 郑州 | 23:36 | 南通 | 13:08 | 13:16 | 启东 | 14:29 |
| T144 | 郑州 | 23:36 | 南通 | 13:08 | 13:16 | 启东 | 14:29 |
| C3766 | 南通 | 13:09 | 南通 | - | 13:09 | 南京 | 15:51 |
| C3721 | 南通 | 13:14 | 南通 | - | 13:14 | 上海虹桥 | 14:48 |
| C3724 | 南通 | 13:14 | 南通 | - | 13:14 | 上海虹桥 | 14:48 |
| K60 | 西安 | 14:12 | 南通 | 13:28 | 13:48 | 海门 | 14:15 |
| K61 | 西安 | 14:12 | 南通 | 13:28 | 13:48 | 海门 | 14:15 |
| G2674 | 郑州航空港 | 08:47 | 南通 | 14:17 | - | 南通 | 14:17 |
| C426 | 启东 | 13:58 | 南通 | 14:44 | 14:50 | 南京 | 17:42 |
| C415 | 南京 | 12:53 | 南通 | 15:27 | 15:29 | 启东 | 16:10 |
| C418 | 南京 | 12:53 | 南通 | 15:27 | 15:29 | 启东 | 16:10 |
| D3155 | 宜昌东 | 07:54 | 南通 | 15:45 | - | 南通 | 15:45 |
| D3158 | 宜昌东 | 07:54 | 南通 | 15:45 | - | 南通 | 15:45 |
| D3156 | 南通 | 16:36 | 南通 | - | 16:36 | 汉口 | 22:00 |
| D3157 | 南通 | 16:36 | 南通 | - | 16:36 | 汉口 | 22:00 |
| K59 | 海门 | 16:18 | 南通 | 16:46 | 16:54 | 西安 | 14:13 |
| K62 | 海门 | 16:18 | 南通 | 16:46 | 16:54 | 西安 | 14:13 |
| K8396 | 南京 | 13:26 | 南通 | 17:02 | - | 南通 | 17:02 |
| K8397 | 南京 | 13:26 | 南通 | 17:02 | - | 南通 | 17:02 |
| C430 | 启东 | 16:32 | 南通 | 17:18 | 17:24 | 南京 | 20:13 |
| C3802 | 上海 | 15:46 | 南通 | 17:29 | - | 南通 | 17:29 |
| Z52 | 启东 | 17:12 | 南通 | 18:03 | 18:25 | 北京 | 07:24 |
| C437 | 南京 | 15:46 | 南通 | 18:18 | 18:21 | 启东 | 19:06 |
| C440 | 南京 | 15:46 | 南通 | 18:18 | 18:21 | 启东 | 19:06 |
| K136 | 南通 | 18:33 | 南通 | - | 18:33 | 昆明 | 11:38 |
| K137 | 南通 | 18:33 | 南通 | - | 18:33 | 昆明 | 11:38 |
| C3761 | 南京 | 16:06 | 南通 | 18:41 | - | 南通 | 18:41 |
| C3764 | 南京 | 16:06 | 南通 | 18:41 | - | 南通 | 18:41 |
| T142 | 启东 | 17:46 | 南通 | 18:46 | 19:06 | 郑州 | 07:31 |
| T143 | 启东 | 17:46 | 南通 | 18:46 | 19:06 | 郑州 | 07:31 |
| Z30 | 启东 | 18:18 | 南通 | 19:08 | 19:15 | 北京丰台 | 07:19 |
| C3718 | 上海虹桥 | 18:39 | 南通 | 19:56 | - | 南通 | 19:56 |
| C438 | 启东 | 19:26 | 南通 | 20:11 | 20:18 | 南京 | 22:55 |
| G2575 | 北京南 | 13:46 | 南通 | 20:15 | - | 南通 | 20:15 |
| D2284 | 东莞南 | 07:39 | 南通 | 20:39 | - | 南通 | 20:39 |
| D2285 | 东莞南 | 07:39 | 南通 | 20:39 | - | 南通 | 20:39 |
| C432 | 南京 | 18:12 | 南通 | 20:52 | 21:00 | 启东 | 21:46 |
| C429 | 南京 | 18:12 | 南通 | 20:52 | 21:00 | 启东 | 21:46 |
| D1663 | 太原南 | 10:50 | 南通 | 20:58 | - | 南通 | 20:58 |
| D1666 | 太原南 | 10:50 | 南通 | 20:58 | - | 南通 | 20:58 |
| K92 | 深圳东 | 17:52 | 南通 | 21:16 | 21:22 | 启东 | 22:23 |
| K93 | 深圳东 | 17:52 | 南通 | 21:16 | 21:22 | 启东 | 22:23 |
| G2656 | 哈尔滨西 | 08:06 | 南通 | 21:29 | - | 南通 | 21:29 |
| G2657 | 哈尔滨西 | 08:06 | 南通 | 21:29 | - | 南通 | 21:29 |
| K1983 | 吉林 | 13:06 | 南通 | 21:41 | 21:46 | 启东 | 22:48 |
| K1986 | 吉林 | 13:06 | 南通 | 21:41 | 21:46 | 启东 | 22:48 |
| G7562 | 宁波 | 18:15 | 南通 | 21:47 | - | 南通 | 21:47 |
| D3206 | 厦门北 | 12:52 | 南通 | 22:00 | - | 南通 | 22:00 |
| C3784 | 南京 | 19:33 | 南通 | 22:05 | - | 南通 | 22:05 |
| C3781 | 南京 | 19:33 | 南通 | 22:05 | - | 南通 | 22:05 |
| D2290 | 深圳北 | 09:15 | 南通 | 22:19 | - | 南通 | 22:19 |
| G2680 | 贵阳北 | 08:55 | 南通 | 22:31 | - | 南通 | 22:31 |
| G2681 | 贵阳北 | 08:55 | 南通 | 22:31 | - | 南通 | 22:31 |
| D3202 | 厦门北 | 13:29 | 南通 | 22:49 | - | 南通 | 22:49 |
| C3818 | 上海 | 21:32 | 南通 | 22:56 | - | 南通 | 22:56 |
| C3710 | 上海虹桥 | 21:47 | 南通 | 23:01 | - | 南通 | 23:01 |
| G1302 | 珠海 | 12:17 | 南通 | 23:06 | - | 南通 | 23:06 |
| D5442 | 南京 | 19:39 | 南通 | 23:14 | - | 南通 | 23:14 |
| D5443 | 南京 | 19:39 | 南通 | 23:14 | - | 南通 | 23:14 |