| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D9502 | 南通 | 05:36 | 南通 | 05:36 | 南京 | 07:55 | 南京 | 07:55 |
| C3782 | 南通 | 06:07 | 南通 | 06:07 | 南京 | 08:42 | 南京 | 08:42 |
| D3152 | 南通 | 06:35 | 南通 | 06:35 | 南京南 | 10:33 | 汉口 | 13:48 |
| D3153 | 南通 | 06:35 | 南通 | 06:35 | 南京南 | 10:33 | 汉口 | 13:48 |
| C3762 | 南通 | 06:54 | 南通 | 06:54 | 南京 | 09:34 | 南京 | 09:34 |
| D5441 | 南通 | 07:07 | 南通 | 07:07 | 南京 | 10:48 | 南京 | 10:48 |
| D5444 | 南通 | 07:07 | 南通 | 07:07 | 南京 | 10:48 | 南京 | 10:48 |
| D9532 | 南通 | 07:13 | 南通 | 07:13 | 南京 | 10:46 | 南京 | 10:46 |
| D9562 | 南通 | 07:17 | 南通 | 07:17 | 南京 | 10:00 | 南京 | 10:00 |
| C422 | 启东 | 06:50 | 南通 | 07:42 | 南京 | 10:17 | 南京 | 10:17 |
| D9495 | 南通 | 07:51 | 南通 | 07:51 | 南京 | 11:20 | 南京 | 11:20 |
| D9498 | 南通 | 07:51 | 南通 | 07:51 | 南京 | 11:20 | 南京 | 11:20 |
| C3856 | 上海 | 08:49 | 南通西 | 09:58 | 南京 | 12:47 | 南京 | 12:47 |
| D9506 | 南通 | 11:27 | 南通 | 11:27 | 南京 | 14:08 | 南京 | 14:08 |
| C3864 | 上海 | 10:20 | 南通西 | 11:43 | 南京 | 14:17 | 南京 | 14:17 |
| C434 | 启东 | 11:45 | 南通 | 12:44 | 南京 | 15:26 | 南京 | 15:26 |
| C3766 | 南通 | 13:09 | 南通 | 13:09 | 南京 | 15:51 | 南京 | 15:51 |
| D9536 | 南通 | 14:04 | 南通 | 14:04 | 南京 | 16:55 | 南京 | 16:55 |
| D9566 | 南通 | 14:30 | 南通 | 14:30 | 南京 | 17:13 | 南京 | 17:13 |
| D9486 | 南通 | 14:30 | 南通 | 14:30 | 南京 | 17:13 | 南京 | 17:13 |
| C426 | 启东 | 13:58 | 南通 | 14:49 | 南京 | 17:42 | 南京 | 17:42 |
| C3868 | 上海 | 13:32 | 南通西 | 15:06 | 南京 | 17:35 | 南京 | 17:35 |
| D9540 | 南通 | 15:33 | 南通 | 15:33 | 南京 | 18:19 | 南京 | 18:19 |
| C3772 | 上海虹桥 | 15:09 | 南通西 | 16:32 | 南京 | 19:03 | 南京 | 19:03 |
| C430 | 启东 | 16:34 | 南通 | 17:23 | 南京 | 20:13 | 南京 | 20:13 |
| K136 | 南通 | 18:28 | 南通 | 18:28 | 南京 | 21:52 | 昆明 | 11:31 |
| K137 | 南通 | 18:28 | 南通 | 18:28 | 南京 | 21:52 | 昆明 | 11:31 |
| C3872 | 上海 | 17:40 | 南通西 | 19:02 | 南京 | 21:28 | 南京 | 21:28 |
| C438 | 启东 | 19:26 | 南通 | 20:18 | 南京 | 22:55 | 南京 | 22:55 |