| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D4563 | 日照 | 23:22 | 扬州东 | 01:46 | 南京 | 02:34 | 南京 | 02:34 |
| D9502 | 南通 | 05:36 | 扬州 | 07:05 | 南京 | 07:55 | 南京 | 07:55 |
| D5401 | 徐州东 | 06:06 | 扬州东 | 07:53 | 南京 | 08:50 | 南京 | 08:50 |
| D5404 | 徐州东 | 06:06 | 扬州东 | 07:53 | 南京 | 08:50 | 南京 | 08:50 |
| D9562 | 南通 | 07:17 | 扬州 | 09:10 | 南京 | 10:00 | 南京 | 10:00 |
| D3152 | 南通 | 06:35 | 扬州东 | 09:31 | 南京南 | 10:33 | 汉口 | 13:48 |
| D3153 | 南通 | 06:35 | 扬州东 | 09:31 | 南京南 | 10:33 | 汉口 | 13:48 |
| D9532 | 南通 | 07:13 | 扬州 | 09:49 | 南京 | 10:46 | 南京 | 10:46 |
| D5441 | 南通 | 07:07 | 扬州东 | 09:50 | 南京 | 10:48 | 南京 | 10:48 |
| D5444 | 南通 | 07:07 | 扬州东 | 09:50 | 南京 | 10:48 | 南京 | 10:48 |
| D2895 | 青岛北 | 06:34 | 扬州东 | 10:03 | 南京南 | 11:03 | 安庆 | 12:46 |
| D2898 | 青岛北 | 06:34 | 扬州东 | 10:03 | 南京南 | 11:03 | 安庆 | 12:46 |
| D9495 | 南通 | 07:51 | 扬州东 | 10:24 | 南京 | 11:20 | 南京 | 11:20 |
| D9498 | 南通 | 07:51 | 扬州东 | 10:24 | 南京 | 11:20 | 南京 | 11:20 |
| D5405 | 徐州东 | 09:08 | 扬州东 | 11:13 | 南京 | 12:17 | 南京 | 12:17 |
| D5408 | 徐州东 | 09:08 | 扬州东 | 11:13 | 南京 | 12:17 | 南京 | 12:17 |
| D5453 | 东台 | 10:30 | 扬州东 | 12:14 | 南京 | 13:20 | 南京 | 13:20 |
| D5456 | 东台 | 10:30 | 扬州东 | 12:14 | 南京 | 13:20 | 南京 | 13:20 |
| D5409 | 宿迁 | 11:18 | 扬州东 | 12:30 | 南京 | 13:28 | 南京 | 13:28 |
| D5412 | 宿迁 | 11:18 | 扬州东 | 12:30 | 南京 | 13:28 | 南京 | 13:28 |
| D2873 | 威海 | 06:55 | 扬州东 | 12:53 | 南京南 | 14:02 | 安庆 | 15:46 |
| D2876 | 威海 | 06:55 | 扬州东 | 12:53 | 南京南 | 14:02 | 安庆 | 15:46 |
| D5445 | 响水县 | 10:43 | 扬州东 | 13:15 | 南京 | 14:16 | 南京 | 14:16 |
| D5448 | 响水县 | 10:43 | 扬州东 | 13:15 | 南京 | 14:16 | 南京 | 14:16 |
| D9506 | 南通 | 11:27 | 扬州 | 13:17 | 南京 | 14:08 | 南京 | 14:08 |
| D5437 | 连云港 | 12:12 | 扬州东 | 14:10 | 南京 | 15:10 | 南京 | 15:10 |
| D5440 | 连云港 | 12:12 | 扬州东 | 14:10 | 南京 | 15:10 | 南京 | 15:10 |
| D5457 | 盐城 | 12:52 | 扬州东 | 14:34 | 南京 | 15:30 | 南京 | 15:30 |
| D9512 | 上海 | 11:47 | 扬州 | 15:14 | 南京 | 16:05 | 南京 | 16:05 |
| D5413 | 徐州东 | 13:03 | 扬州东 | 15:18 | 南京 | 16:12 | 南京 | 16:12 |
| D5416 | 徐州东 | 13:03 | 扬州东 | 15:18 | 南京 | 16:12 | 南京 | 16:12 |
| D5429 | 赣榆 | 13:26 | 扬州东 | 15:27 | 南京 | 16:21 | 南京 | 16:21 |
| D5432 | 赣榆 | 13:26 | 扬州东 | 15:27 | 南京 | 16:21 | 南京 | 16:21 |
| D9536 | 南通 | 14:04 | 扬州 | 16:04 | 南京 | 16:55 | 南京 | 16:55 |
| D5515 | 徐州东 | 13:54 | 扬州东 | 16:05 | 南京南 | 17:05 | 安庆 | 18:53 |
| D9486 | 南通 | 14:30 | 扬州 | 16:21 | 南京 | 17:13 | 南京 | 17:13 |
| D9566 | 南通 | 14:30 | 扬州 | 16:21 | 南京 | 17:13 | 南京 | 17:13 |
| D5461 | 盐城 | 15:24 | 扬州东 | 16:54 | 南京 | 17:55 | 南京 | 17:55 |
| D5464 | 盐城 | 15:24 | 扬州东 | 16:54 | 南京 | 17:55 | 南京 | 17:55 |
| D3186 | 青岛北 | 13:08 | 扬州东 | 17:01 | 南京南 | 17:57 | 南昌西 | 22:00 |
| D3187 | 青岛北 | 13:08 | 扬州东 | 17:01 | 南京南 | 17:57 | 南昌西 | 22:00 |
| D2865 | 青岛北 | 13:21 | 扬州东 | 17:11 | 南京南 | 18:13 | 南京南 | 18:13 |
| D2868 | 青岛北 | 13:21 | 扬州东 | 17:11 | 南京南 | 18:13 | 南京南 | 18:13 |
| D9540 | 南通 | 15:33 | 扬州 | 17:29 | 南京 | 18:19 | 南京 | 18:19 |
| D5495 | 东台 | 17:57 | 扬州东 | 19:43 | 南京 | 20:39 | 南京 | 20:39 |
| D5498 | 东台 | 17:57 | 扬州东 | 19:43 | 南京 | 20:39 | 南京 | 20:39 |
| D2869 | 烟台 | 15:12 | 扬州东 | 20:07 | 南京南 | 21:18 | 合肥南 | 22:13 |
| D2872 | 烟台 | 15:12 | 扬州东 | 20:07 | 南京南 | 21:18 | 合肥南 | 22:13 |
| D2105 | 济南东 | 15:44 | 扬州东 | 20:47 | 南京南 | 21:52 | 南京南 | 21:52 |
| D2108 | 济南东 | 15:44 | 扬州东 | 20:47 | 南京南 | 21:52 | 南京南 | 21:52 |
| D5491 | 东台 | 19:15 | 扬州东 | 20:57 | 南京南 | 22:00 | 南京南 | 22:00 |
| D5494 | 东台 | 19:15 | 扬州东 | 20:57 | 南京南 | 22:00 | 南京南 | 22:00 |
| D5471 | 徐州东 | 19:24 | 扬州东 | 21:22 | 南京南 | 22:23 | 南京南 | 22:23 |
| D5474 | 徐州东 | 19:24 | 扬州东 | 21:22 | 南京南 | 22:23 | 南京南 | 22:23 |
| D5452 | 响水县 | 18:49 | 扬州东 | 21:31 | 南京 | 22:27 | 南京 | 22:27 |
| D5475 | 宿迁 | 21:01 | 扬州东 | 22:14 | 南京南 | 23:10 | 南京南 | 23:10 |