| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D5441 | 南通 | 07:07 | 如皋南 | 07:28 | 南京 | 10:48 | 南京 | 10:48 |
| D5444 | 南通 | 07:07 | 如皋南 | 07:28 | 南京 | 10:48 | 南京 | 10:48 |
| D9532 | 南通 | 07:13 | 如皋 | 07:40 | 南京 | 10:46 | 南京 | 10:46 |
| D9562 | 南通 | 07:17 | 如皋 | 07:44 | 南京 | 10:00 | 南京 | 10:00 |
| D9506 | 南通 | 11:27 | 如皋 | 11:54 | 南京 | 14:08 | 南京 | 14:08 |
| D9512 | 上海 | 11:47 | 如皋 | 13:50 | 南京 | 16:05 | 南京 | 16:05 |
| D9536 | 南通 | 14:04 | 如皋 | 14:32 | 南京 | 16:55 | 南京 | 16:55 |
| D9566 | 南通 | 14:30 | 如皋 | 14:57 | 南京 | 17:13 | 南京 | 17:13 |
| D9486 | 南通 | 14:30 | 如皋 | 14:57 | 南京 | 17:13 | 南京 | 17:13 |
| D9540 | 南通 | 15:33 | 如皋 | 16:01 | 南京 | 18:19 | 南京 | 18:19 |