| 车次 | 始发站 | 始发时间 | 出发站 | 开车时间 | 到达站 | 到达时间 | 终点站 | 终到时间 |
| D5401 | 徐州东 | 06:06 | 宿迁 | 06:40 | 南京 | 08:50 | 南京 | 08:50 |
| D5404 | 徐州东 | 06:06 | 宿迁 | 06:40 | 南京 | 08:50 | 南京 | 08:50 |
| D5405 | 徐州东 | 09:08 | 宿迁 | 09:54 | 南京 | 12:13 | 南京 | 12:13 |
| D5408 | 徐州东 | 09:08 | 宿迁 | 09:54 | 南京 | 12:13 | 南京 | 12:13 |
| D5409 | 宿迁 | 11:16 | 宿迁 | 11:16 | 南京 | 13:28 | 南京 | 13:28 |
| D5412 | 宿迁 | 11:16 | 宿迁 | 11:16 | 南京 | 13:28 | 南京 | 13:28 |
| D5413 | 徐州东 | 13:09 | 宿迁 | 13:43 | 南京 | 16:12 | 南京 | 16:12 |
| D5416 | 徐州东 | 13:09 | 宿迁 | 13:43 | 南京 | 16:12 | 南京 | 16:12 |
| D5417 | 宿迁 | 14:59 | 宿迁 | 14:59 | 南京 | 17:18 | 南京 | 17:18 |
| D5471 | 徐州东 | 19:24 | 宿迁 | 20:10 | 南京南 | 22:23 | 南京南 | 22:23 |
| D5474 | 徐州东 | 19:24 | 宿迁 | 20:10 | 南京南 | 22:23 | 南京南 | 22:23 |